一九一八年,杨仙逸受孙中山电召回国,共商国事。那时革命还是处于低潮。袁世凯这个窃国大盗虽死,黎元洪继任总统,军政大权仍落在北洋军阀手中.他们为了巩固政权,解散了国会,废除了约法.孙中山在广州举起了护法的旗帜,和那些军阀作坚决的斗争.可是,在广州,军政却落在广西军阀莫荣新等人手中,对军政府事事掣肘,甚至公然排斥孙中山.杨仙逸觉得南、北军阀都是“一丘之貉 ”。在这样情况下。感到自己的担子非常之重,如何消灭桂系军阀是急不容缓的。时适杨仙逸奉命往福建漳州筹备组织我国第一支飞机队,并担任总指挥。他自念此行任务重大,决不能有负孙先生的重托,于是精心策划,积极筹备。不久,桂系军阀莫荣新叛变,并盘踞广州越秀山一带负隅顽抗。为了结束军阀割据的局面,以杨仙逸为总指挥的“援闽粤军飞机队”,于一九二O年八月,奉命从福建回师广东,配合援闽粤军作战。杨仙逸率领的飞机队在广州上空投下传单,声讨莫荣新的罪状,并向越秀山敌占区投弹。莫荣新叛军在陆、海、空军的夹击下,抱头鼠窜。就这样,一场内战平息了。杨仙逸当时指挥部属配合陆海军作战之功,殊不可没。经过讨伐莫荣新战事,杨仙逸对航空救国更有信心,为了扩大飞机队,他奉派到日本、美国、檀香山、墨西哥等地向华侨筹款购机。杨仙逸到檀香山时,著昆老先生极力赞助,用个人的财产购机四架,献给祖国。他父子两人出钱出力,大大鼓舞了海外爱国侨胞。跟着,杨仙逸去美、日等筹款,又购回飞机八架,就这样组成了我国第一支空军队伍。
一九二三年二月,孙中山在广州成立大元帅府,杨仙逸被任命为航空局长,在广州大沙头设立航空局。接着,又筹办了广东飞机制造厂,杨兼任厂长,并亲自领导航空和飞机制造工作。他为了培养祖国的飞行员,曾挑选有志于飞行者黄光锐等数十人,派往美国入航空专业学校学习,这批人后来成为我国早期的飞行人员。
当时的飞机制造厂,不论厂房工具等设备都十分简陋,而制造飞机的专业人才尤为缺乏。虽然困难重重,但在有雄心勃勃的杨仙逸厂长指导下工作,大家一起劳动,同甘共苦,得到孙中山的关心,并寄予很大的希望。他经常和夫人宋庆龄女士亲临视察,鼓励大家努力工作。数月后,制成了第一架飞机,命名为“乐士文”号,该名是宋庆龄青年时代的英文名“ROSAMONDE”的译音。试飞之日,孙中山与夫人亲自到大沙头机场,由黄光锐当试飞员驾驶,孙夫人从容登上后座,共同试飞。从这里可以看出宋庆龄对杨仙逸的信赖。起飞后,环绕广州上空数周,飞机性能良好,安全降落。孙中山上前与杨仙逸、黄光锐等一一握手,祝贺试航成功,并且同全体职工在机场拍照,又与宋庆龄二人在“乐士文”号合影留念,这次为我国航空制造业开了新纪元。为了表彰杨仙逸的卓越功勋,鼓励其继续努力,孙中山亲笔书写“志在冲天”的横幅赠送给他。辛亥革命七十周年时,杨仙逸之予杨添霭及媳妇郑瑞安应邀从美国回国参加纪念活动,把“志在冲天”的横幅献给祖国,由广东省委第一书记任仲夷和省长刘田夫接收。现已送博物馆珍藏。 一九二三年九月,军阀陈炯明盘踞东江惠州一带,发动叛动。杨仙逸以陈逆素来受孙中山栽培提携,一旦羽翼已成,即想树立个人势力,忘恩负义,实狗?不如。当时孙先生派遣大军讨伐,并在博罗、雄鸡拍翼山督战,还亲自发炮轰击叛军,杨仙逸亦参与作战。但惠州城高壁坚,陈逆负隅顽抗,一时难以攻破。在博罗梅湖白沙堆前线,杨仙逸又建议从水路进攻敌人。于九月二十日,杨仙逸与水雷队长谢铁良、长洲要赛司令崇山、虎门要赛司令瑞鳞、飞行员吴顾之五人,检查水雷时不慎爆炸,五人皆壮烈牺牲。正所谓“出师未捷身先死,长使英雄泪满襟”。孙中山先生闻之,深为痛惜,随即命令所属各部四出寻找烈士遗体。当时驻石龙的飞机掩护队,由林伟成率领,出动火船沿海搜索,终于次日清晨,在往博罗的回程中,发现水面浮起一对机翼,中间夹着一具尸体,验明是杨仙逸的遗体。后来,其他队伍亦先后将谢、苏、马、吴四位烈士的遗体寻获。孙中山和大元帅府决定,对为革命遇难的烈士进行厚葬。对于杨仙逸烈士,大元帅府还下抚恤令,并追认陆军中将,规定每年九月二十日为空军节。