萧泰然1938年元旦出生于台湾高雄凤山的长老教会家庭
萧泰然高中就读于台南市长荣中学，齿科医生的萧父原本希望长子能继承衣钵，要求萧泰然在高中毕业后选读医学院，在长荣中学校长戴明福惜才之下向萧父说项才允许萧泰然攻读音乐。
萧泰然在高三时师事于留日钢琴家高锦花钢琴老师，以准备投考音乐学校。在1959年时考进台湾省立师范学院音乐专修科(今国立台湾师范大学音乐系前身），主修钢琴演奏，师事于留美钢琴家李富美老师，并受到刚自法国巴黎回国的音乐家许常惠老师的注意而指导萧泰然走入作曲。此时，具有基督教信仰的萧泰然已开始尝试创作一些宗教歌曲及合唱曲。1963年师大毕业后，萧泰然与同是长老教会的台南望族高长传道师后代高仁慈小姐结婚，并任教于高雄二中初中部（今雄中）担任音乐老师。
1965年，萧泰然赴日本武藏野音乐大学键盘专攻科深造，师事于钢琴教授中根伸也。也同时受到和声学教授藤本秀夫（Fujimoto Hideo）的赏识，私下免费传授萧泰然作曲。
1967年学成返回高雄，萧泰然开始其十年的教学、演出和发表的生涯。萧泰然以教钢琴为主，作曲为辅，曾先后任教于高雄文藻女子外语专校，高雄女师专（今之国立高雄师范大学）及台南家专，台南神学院等学校。同时，也与小提琴教育家李淑德成立的青少年管弦乐团合作，担任客席指挥。1972年代表中华民国赴马尼拉出席第一届东南亚圣乐会议，同年应高雄市立交响乐团之邀，由陈澄雄教授客席指挥，合作演出贝多芬第三号钢琴协奏曲。而一方面也向旅居台湾的奥籍音乐家罗伯?萧兹教授（Dr. Robert Scholz）学习钢琴和作曲技巧。
在台其间，萧泰然出版不少个人作品。1967年萧泰然出版其第一部萧泰然合唱曲集。1971年出版由其父亲萧瑞安长老编词，萧泰然谱曲，全部分八章的神剧《耶稣基督》。萧泰然在自序中说：“这部神剧是我对家父永远的尊敬和思念；同时也是我对上帝的信仰告白，及感谢的礼物。”1975年在台北中山堂首次举行“萧泰然乐展”。
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